Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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