Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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