Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms