Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms