Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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