Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RUNX3Q13761 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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