Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CUL3Q13618 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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