Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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