Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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