Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HMGB1P1B2RPK0 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms