Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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