Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms