Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ZNF548Q8NEK5 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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