Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms