Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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