Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms