Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms