Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RAB39AQ14964 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms