Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms