Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms