Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TCIRG1Q13488 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms