Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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