Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TCOF1Q13428 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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