Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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