Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CENPFP49454 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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CENPFP49454 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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