Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CASQ1P31415 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CASQ1P31415 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CASQ1P31415 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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CASQ1P31415 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CASQ1P31415 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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