Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB5P28074 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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