Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms