Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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