Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 633.3 ms