Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms