Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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