Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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