Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PI4K2AQ9BTU6 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PI4K2AQ9BTU6 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms