Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SGCZQ96LD1 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms