Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF148Q8N7C7 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms