Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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