Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms