Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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