Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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