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| FHL3 | Q13643 | SLC14A1-201 | ENST00000321925 | 3971 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | ELMO1-207 | ENST00000442504 | 3154 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC020571.1-202 | ENST00000433933 | 1413 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC026620.1-201 | ENST00000584815 | 326 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | WDR7-OT1-201 | ENST00000592032 | 565 nt | TSL 4 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | VN1R82P-201 | ENST00000601481 | 356 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC011453.2-201 | ENST00000603737 | 729 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC01320-205 | ENST00000604250 | 857 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | MMP13-203 | ENST00000615555 | 1152 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC005840.5-201 | ENST00000619166 | 599 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | CLECL1-204 | ENST00000621400 | 611 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL512506.2-201 | ENST00000624472 | 458 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | FLRT3-202 | ENST00000378053 | 4776 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | NUP93-202 | ENST00000542526 | 8257 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | NCOR1-204 | ENST00000395851 | 7950 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | ITCH-201 | ENST00000262650 | 3089 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | RABL3-201 | ENST00000273375 | 3883 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | DPYD-202 | ENST00000370192 | 4412 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | PLEKHA1-205 | ENST00000433307 | 3704 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | MROH2B-203 | ENST00000506092 | 3745 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | ALS2CR12-201 | ENST00000286190 | 1769 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | AIMP1-202 | ENST00000394701 | 2586 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | SMIM21-203 | ENST00000584508 | 2554 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | MYO6-201 | ENST00000369975 | 5387 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | PLCH1-203 | ENST00000447496 | 6196 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FHL3 | Q13643 | CBLB-205 | ENST00000407712 | 1493 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |