Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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