Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms