Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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