Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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