Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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