Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRFP10586 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms