Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms