Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED7Q9Y3B3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms