Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms